24 мар. 2014 г.

Установка LAMMPS под систему с GPU

Также как и в случае с Quantum Espresso LAMMPS был дописан для работы с CPU-GPU кластерами. Здесь я опишу краткую инструкцию по его установке на такие системы.
В принципе, установка мало чем отличается от процесса установки на обычный кластер, описанный тут, кроме собирание отдельной библиотеки GPU для LAMMPS.
Итак, качаем последнюю версию LAMMPS, заходим в разархивированную папка и идем в папку с библиотекой GPU:

cd lammps-24Apr13/lib/gpu

после чего редактируем в файле Makefile.linux строки:

Установка QE под систему с GPU

В настоящее время все более востребованными стали вычислительные кластеры, которые содержат в себе не только классические CPU, но и графические ускорители GPU, которые позволяют в разы увеличить производительность вычислительных кластеров. В связи с этим многим людям кажется привлекательным проводить расчеты на гибридных CPU-GPU системах. Для этих целей, разработчики программных пакетов пару лет назад начали переписывать/дописывать/улучшать коды своих программа для работы на GPU системах или гибридных CPU-GPU, что у них очень удачно получается на данный момент.
Однако суть вопроса в том, как установить такие пакеты на свой кластер с GPU. Здесь я опишу краткую инструкцию по установке Quantum Espresso на кластер с GPU, т.к. она немного отличается от тривиальной и очень простой установки этого пакета на CPU систему.